Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
SLC4A9Q96Q91 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
SLC4A9Q96Q91 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC4A9Q96Q91 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC4A9Q96Q91 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
SLC4A9Q96Q91 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC4A9Q96Q91 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC4A9Q96Q91 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC4A9Q96Q91 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC4A9Q96Q91 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLC4A9Q96Q91 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLC4A9Q96Q91 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SLC4A9Q96Q91 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms