Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ODF3Q96PU9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ODF3Q96PU9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms