Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPALINQ96PE5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPALINQ96PE5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPALINQ96PE5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms