Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN4Q96NY8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NECTIN4Q96NY8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NECTIN4Q96NY8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NECTIN4Q96NY8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms