Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLUHP3Q96NS8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLUHP3Q96NS8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms