Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C9orf72Q96LT7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C9orf72Q96LT7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C9orf72Q96LT7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C9orf72Q96LT7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms