Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX27Q96L92 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX27Q96L92 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX27Q96L92 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX27Q96L92 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX27Q96L92 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms