Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PKNOX2Q96KN3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKNOX2Q96KN3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKNOX2Q96KN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKNOX2Q96KN3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms