Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DCHS1Q96JQ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCHS1Q96JQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DCHS1Q96JQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCHS1Q96JQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms