Protein–RNA interactions for Protein: Q96J02

ITCH, E3 ubiquitin-protein ligase Itchy homolog, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITCHQ96J02 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITCHQ96J02 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITCHQ96J02 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITCHQ96J02 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITCHQ96J02 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms