Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CENPNQ96H22 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CENPNQ96H22 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CENPNQ96H22 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CENPNQ96H22 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms