Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMARCD1Q96GM5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMARCD1Q96GM5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SMARCD1Q96GM5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMARCD1Q96GM5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SMARCD1Q96GM5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms