Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EDC3Q96F86 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EDC3Q96F86 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
EDC3Q96F86 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EDC3Q96F86 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EDC3Q96F86 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
EDC3Q96F86 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
EDC3Q96F86 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms