Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX3

WDR34, WD repeat-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR34Q96EX3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
WDR34Q96EX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
WDR34Q96EX3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
WDR34Q96EX3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR34Q96EX3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR34Q96EX3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR34Q96EX3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR34Q96EX3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR34Q96EX3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WDR34Q96EX3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR34Q96EX3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WDR34Q96EX3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms