Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MALSU1Q96EH3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MALSU1Q96EH3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MALSU1Q96EH3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms