Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SYAP1Q96A49 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SYAP1Q96A49 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SYAP1Q96A49 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SYAP1Q96A49 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SYAP1Q96A49 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms