Protein–RNA interactions for Protein: Q969M7

UBE2F, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2FQ969M7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE2FQ969M7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBE2FQ969M7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2FQ969M7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2FQ969M7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms