Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD50Q92878 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD50Q92878 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD50Q92878 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD50Q92878 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RAD50Q92878 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
RAD50Q92878 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAD50Q92878 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RAD50Q92878 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD50Q92878 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms