Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY07

SLC7A3, Cationic amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A3Q8WY07 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC7A3Q8WY07 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC7A3Q8WY07 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC7A3Q8WY07 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC7A3Q8WY07 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms