Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CASKIN2Q8WXE0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASKIN2Q8WXE0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CASKIN2Q8WXE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASKIN2Q8WXE0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms