Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.86
CASKIN1Q8WXD9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CASKIN1Q8WXD9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
CASKIN1Q8WXD9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CASKIN1Q8WXD9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.82
CASKIN1Q8WXD9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.85■■■■□ 3.81
CASKIN1Q8WXD9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms