Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APH1BQ8WW43 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APH1BQ8WW43 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APH1BQ8WW43 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms