Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM8

SCFD1, Sec1 family domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1Q8WVM8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCFD1Q8WVM8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SCFD1Q8WVM8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCFD1Q8WVM8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCFD1Q8WVM8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCFD1Q8WVM8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms