Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB2BQ8WUD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB2BQ8WUD1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB2BQ8WUD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB2BQ8WUD1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms