Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDD1Q8TEB9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHBDD1Q8TEB9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHBDD1Q8TEB9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms