Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR2

STK35, Serine/threonine-protein kinase 35, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35Q8TDR2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STK35Q8TDR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STK35Q8TDR2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms