Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HAVCR2Q8TDQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HAVCR2Q8TDQ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HAVCR2Q8TDQ0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms