Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNIH3Q8TBE1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNIH3Q8TBE1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH3Q8TBE1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms