Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SVIPQ8NHG7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SVIPQ8NHG7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVIPQ8NHG7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVIPQ8NHG7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms