Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP35Q8NFH5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP35Q8NFH5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP35Q8NFH5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms