Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LPCAT1Q8NF37 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LPCAT1Q8NF37 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LPCAT1Q8NF37 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LPCAT1Q8NF37 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LPCAT1Q8NF37 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms