Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPATA4Q8NEY3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPATA4Q8NEY3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPATA4Q8NEY3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPATA4Q8NEY3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPATA4Q8NEY3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPATA4Q8NEY3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPATA4Q8NEY3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPATA4Q8NEY3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPATA4Q8NEY3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms