Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TMEM229BQ8NBD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM229BQ8NBD8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM229BQ8NBD8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms