Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SCML4Q8N228 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCML4Q8N228 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCML4Q8N228 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCML4Q8N228 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCML4Q8N228 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCML4Q8N228 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SCML4Q8N228 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SCML4Q8N228 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SCML4Q8N228 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCML4Q8N228 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCML4Q8N228 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms