Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF2Q8IX21 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLF2Q8IX21 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLF2Q8IX21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SLF2Q8IX21 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF2Q8IX21 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms