Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC8AQ8IWT6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC8AQ8IWT6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC8AQ8IWT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC8AQ8IWT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC8AQ8IWT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC8AQ8IWT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC8AQ8IWT6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms