Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL8

CPO, Carboxypeptidase O, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPOQ8IVL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CPOQ8IVL8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CPOQ8IVL8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPOQ8IVL8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms