Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUZ0

LRRC49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC49Q8IUZ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC49Q8IUZ0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC49Q8IUZ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC49Q8IUZ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRRC49Q8IUZ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRC49Q8IUZ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms