Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TREML1Q86YW5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TREML1Q86YW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TREML1Q86YW5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TREML1Q86YW5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms