Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MARCH9Q86YJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MARCH9Q86YJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCH9Q86YJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCH9Q86YJ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms