Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHFPL3Q86UP9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHFPL3Q86UP9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LHFPL3Q86UP9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LHFPL3Q86UP9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms