Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC41.59■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
PBRM1Q86U86 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
PBRM1Q86U86 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
PBRM1Q86U86 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
PBRM1Q86U86 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.21
PBRM1Q86U86 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
PBRM1Q86U86 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
PBRM1Q86U86 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms