Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINA11Q86U17 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINA11Q86U17 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINA11Q86U17 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms