Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG4DQ86TL0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG4DQ86TL0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG4DQ86TL0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms