Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM46Q7Z4K8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM46Q7Z4K8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM46Q7Z4K8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms