Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ATG9AQ7Z3C6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ATG9AQ7Z3C6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG9AQ7Z3C6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG9AQ7Z3C6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ATG9AQ7Z3C6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ATG9AQ7Z3C6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
ATG9AQ7Z3C6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ATG9AQ7Z3C6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ATG9AQ7Z3C6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ATG9AQ7Z3C6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ATG9AQ7Z3C6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms