Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRADAQ7RTN6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRADAQ7RTN6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRADAQ7RTN6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
STRADAQ7RTN6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
STRADAQ7RTN6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
STRADAQ7RTN6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
STRADAQ7RTN6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
STRADAQ7RTN6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRADAQ7RTN6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms