Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
UBR3Q6ZT12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
UBR3Q6ZT12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
UBR3Q6ZT12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
UBR3Q6ZT12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
UBR3Q6ZT12 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
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