Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
C15orf39Q6ZRI6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
C15orf39Q6ZRI6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C15orf39Q6ZRI6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C15orf39Q6ZRI6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms