Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LBX2Q6XYB7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LBX2Q6XYB7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LBX2Q6XYB7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LBX2Q6XYB7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms